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北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)簡(jiǎn)介
北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)集成多源健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)、采用國(guó)際前沿的數(shù)據(jù)處理和分析技術(shù),為國(guó)家健康醫(yī)療戰(zhàn)略、醫(yī)學(xué)實(shí)踐和全人群健康管理提供大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的決策支持服務(wù)。
平臺(tái)集中部署運(yùn)行在北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國(guó)家研究院自建機(jī)房,可實(shí)現(xiàn)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化、流程化、自動(dòng)化、系統(tǒng)化的專業(yè)安全運(yùn)維管理。
2019年4月\2020年12月,北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)兩次通過(guò)了中國(guó)信息安全測(cè)評(píng)中心的國(guó)家信息系統(tǒng)安全等級(jí)保護(hù)三級(jí)測(cè)評(píng)(業(yè)務(wù)信息安全等級(jí)為第三級(jí)、系統(tǒng)服務(wù)安全等級(jí)為第三級(jí)、網(wǎng)絡(luò)安全保護(hù)等級(jí)為第三級(jí)【S3A3】
依照2019年5月國(guó)務(wù)院頒布《中華人民共和國(guó)人類遺傳資源管理?xiàng)l例》,北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國(guó)家研究院按政策引導(dǎo)建設(shè)了北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)分析保藏平臺(tái),建設(shè)方案經(jīng)我校倫理委員會(huì)審批后遞交科技部中國(guó)人類遺傳資源管理辦公室申請(qǐng)保藏行政許可。2020年8月5日上午,由中國(guó)人類遺傳資源管理辦公室組織的專家團(tuán)對(duì)我院保藏平臺(tái)進(jìn)行了現(xiàn)場(chǎng)勘查評(píng)審。2020年8月25日,獲得中國(guó)人類遺傳資源管理辦公室行政審批許可。
公示鏈接:https://fuwu.most.gov.cn/html/rlycjgcx/20200826/123123436.html
北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)由大數(shù)據(jù)分析模塊和高性能計(jì)算模塊組成。大數(shù)據(jù)分析模塊支持多源異構(gòu)數(shù)據(jù)存取及智能多維度建模分析,可實(shí)現(xiàn)多源異構(gòu)的數(shù)據(jù)查詢、數(shù)據(jù)模型建設(shè)、數(shù)據(jù)挖掘等功能,滿足不同業(yè)務(wù)的數(shù)據(jù)分析需求(數(shù)據(jù)源探查、面向醫(yī)生的科研查詢、統(tǒng)計(jì)分析、關(guān)聯(lián)分析、聚類分析、分類分析等),并且支持多元化統(tǒng)計(jì)分析軟件的集成。同時(shí)大數(shù)據(jù)分析模塊處理后的數(shù)據(jù)可流轉(zhuǎn)到高性能計(jì)算模塊,通過(guò)CPU和GPU服務(wù)器的高效并行計(jì)算能力進(jìn)行分析,計(jì)算后的結(jié)果可通過(guò)大數(shù)據(jù)分析模塊中的數(shù)據(jù)展示功能進(jìn)行多種可視化形式多維度展示分析成果。
北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)由10Gb與40Gb高速以太網(wǎng)互聯(lián)連接,其中大數(shù)據(jù)分析模塊各節(jié)點(diǎn)存儲(chǔ)均由固態(tài)硬盤組成,存儲(chǔ)可用容量為210TB、一共有2304GB DDR4內(nèi)存。高性能計(jì)算模塊共有660個(gè)處理器核心、4480GB DDR4內(nèi)存、34塊GPU卡,存儲(chǔ)可用容量1.28PB,讀寫性能9GB/s,總計(jì)算能力達(dá)到2776.25TFLOPS。
北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)依托北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國(guó)家研究院優(yōu)勢(shì),在通過(guò)信息系統(tǒng)安全等級(jí)保護(hù)三級(jí)的安全保障下,開展了如下項(xiàng)目:
醫(yī)學(xué)影像分析:利用高性能計(jì)算模塊中CPU和GPU服務(wù)器的高效并行計(jì)算能力,針對(duì)于醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù),采用深度學(xué)習(xí)和圖像處理技術(shù)對(duì)公開或者非公開的生物醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)集與自然圖集進(jìn)行圖像分割、圖像分類、目標(biāo)識(shí)別等分析,從而形成智能化、自動(dòng)化模型,用以達(dá)到輔助診斷、輔助臨床決策等目的。
組學(xué)大數(shù)據(jù)分析:針對(duì)于多組學(xué)數(shù)據(jù),采用了深度學(xué)習(xí)和機(jī)器學(xué)習(xí)等技術(shù)鑒別疾病組與正常組的差異,聯(lián)系臨床癥狀,探究疾病發(fā)生發(fā)展的(表觀)遺傳因素,為疾病的早診和治療提供理論依據(jù)。
NCIS數(shù)據(jù)分析:NCIS醫(yī)療質(zhì)量控制數(shù)據(jù)收集系統(tǒng),在2016年—2019年四年內(nèi),持續(xù)有近一萬(wàn)家醫(yī)院在系統(tǒng)上填報(bào)本醫(yī)療機(jī)構(gòu)的醫(yī)療質(zhì)量控制數(shù)據(jù)。2018年和2019年還搜集了近四千家醫(yī)院的病案首頁(yè)數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù),為衛(wèi)健委編寫的2015年度、2016年度、2017年度、2018年度《國(guó)家醫(yī)療服務(wù)與質(zhì)量安全報(bào)告》提供了客觀、科學(xué)的數(shù)據(jù)參考;也為各醫(yī)療機(jī)構(gòu)充分展現(xiàn)了本醫(yī)療機(jī)構(gòu)的醫(yī)療服務(wù)狀況及醫(yī)療質(zhì)量水平,共同為科學(xué)評(píng)價(jià)行業(yè)醫(yī)療質(zhì)量水平提供了充足的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。
北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)可提供的服務(wù):
1、 高性能計(jì)算服務(wù)
利用高性能計(jì)算模塊中CPU和GPU服務(wù)器的高效并行計(jì)算能力及大容量磁盤陣列數(shù)據(jù)存儲(chǔ)的支撐,采用了大數(shù)據(jù)、深度學(xué)習(xí)、機(jī)器學(xué)習(xí)的分析技術(shù),可以更好的對(duì)醫(yī)療影像或多組學(xué)等數(shù)據(jù)集的存儲(chǔ)、分析、處理。
2、 大數(shù)據(jù)分析服務(wù)
利用大數(shù)據(jù)集群服務(wù)器的高速計(jì)算讀寫能力,支持對(duì)多源異構(gòu)數(shù)據(jù)存取及智能多維度建模分析,可實(shí)現(xiàn)多源異構(gòu)的數(shù)據(jù)查詢、數(shù)據(jù)模型建設(shè)、數(shù)據(jù)挖掘等功能,滿足不同業(yè)務(wù)的數(shù)據(jù)分析需求。
3、 服務(wù)器托管運(yùn)維/安全保障服務(wù)
4、 虛擬服務(wù)器租用服務(wù)
(注:詳情請(qǐng)參見附錄北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國(guó)家研究院計(jì)算中心資源收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn))
北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)將竭誠(chéng)為醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的高性能計(jì)算用戶提供高質(zhì)量的高性能計(jì)算服務(wù)、以及安全穩(wěn)定的數(shù)據(jù)中心機(jī)房托管環(huán)境,歡迎大家使用!
附錄1
北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國(guó)家研究院
計(jì)算中心資源收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)
北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國(guó)家研究院依據(jù)《計(jì)算中心資源使用管理制度》,參考IDC機(jī)房服務(wù)的市場(chǎng)價(jià)格,收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)如下:
項(xiàng)目 |
規(guī)格 |
使用費(fèi)用(元/月) |
備注 |
占地費(fèi) |
1U |
800 |
|
2U |
1200 |
||
4U |
1600 |
||
帶寬 費(fèi)用 |
帶寬 |
使用費(fèi)用(元/月) |
備注 |
10Mbps |
3800 |
||
50Mbps |
9000 |
||
100Mbps |
12000 |
||
計(jì)算公式 |
托管費(fèi)=占地費(fèi)+帶寬 例:1U服務(wù)器+10Mbps帶寬=800+3800=4600元/月;托管服務(wù)器都需要獨(dú)立申請(qǐng)帶寬,不與計(jì)算中心自有服務(wù)器共享 |
校內(nèi)用戶:
項(xiàng)目 |
規(guī)格 |
使用費(fèi)用 |
是否選用 |
虛擬服務(wù)器租用 |
1個(gè)虛擬CPU 1G內(nèi)存, 30G硬盤空間(SAS硬盤) |
125元/月 |
CPU(個(gè)): 內(nèi)存(G): 硬盤(G): |
1個(gè)虛擬CPU 1G內(nèi)存, 30G硬盤空間(SSD硬盤) |
250元/月 |
CPU(個(gè)): 內(nèi)存(G): 硬盤(G): |
|
備注 |
-每增加1個(gè)CPU費(fèi)用為50元/月 -每增加1G內(nèi)存費(fèi)用為20元/月 -每增加10G磁盤(SAS硬盤)空間費(fèi)用為10元/月,每增加10G磁盤(SSD硬盤)空間費(fèi)用為20元/月 *最小租用單位為月 *默認(rèn)共享100M帶寬,申請(qǐng)獨(dú)立帶寬需額外收費(fèi) |
校外用戶:
項(xiàng)目 |
規(guī)格 |
使用費(fèi)用 |
是否選用 |
虛擬服務(wù)器租用 |
1個(gè)虛擬CPU 1G內(nèi)存, 30G硬盤空間(SAS硬盤) |
250元/月 |
CPU(個(gè)): 內(nèi)存(G): 硬盤(G): |
1個(gè)虛擬CPU 1G內(nèi)存, 30G硬盤空間(SSD硬盤) |
500元/月 |
CPU(個(gè)): 內(nèi)存(G): 硬盤(G): |
|
備注 |
-每增加1個(gè)CPU費(fèi)用為100元/月 -每增加1G內(nèi)存費(fèi)用為40元/月 -每增加10G磁盤(SAS硬盤)空間費(fèi)用為20元/月,每增加10G磁盤(SSD硬盤)空間費(fèi)用為40元/月 *最小租用單位為月 *默認(rèn)共享100M帶寬,申請(qǐng)獨(dú)立帶寬需額外收費(fèi) |
校內(nèi)用戶:
計(jì)費(fèi)類別 |
計(jì)費(fèi)方式 |
節(jié)點(diǎn)類型 |
使用費(fèi)用 |
節(jié)點(diǎn)共享 |
作業(yè)與其他用戶的作業(yè)一起排隊(duì),所需資源具備時(shí)開始運(yùn)行。不限使用時(shí)長(zhǎng),最小單位為月 |
CPU節(jié)點(diǎn) |
800元/月*節(jié)點(diǎn) |
GPU節(jié)點(diǎn) |
2000元/月*節(jié)點(diǎn) |
||
節(jié)點(diǎn)獨(dú)享(GPU不允許獨(dú)享) |
用戶對(duì)租用的節(jié)點(diǎn)獨(dú)占使用,無(wú)需排隊(duì)。不限使用時(shí)長(zhǎng),最小單位為月。平臺(tái)提供給獨(dú)占使用的節(jié)點(diǎn)數(shù)不高于總計(jì)算資源的20% |
CPU節(jié)點(diǎn) |
1800元/月*節(jié)點(diǎn) |
儲(chǔ)存資源 |
用戶在計(jì)算節(jié)點(diǎn)中須使用單獨(dú)的用戶HOME目錄,目錄大小進(jìn)行限制。最小單位為月 |
存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn) |
120元 / 月*1TB |
備注 |
最小租用單位為月;多個(gè)項(xiàng)目共享節(jié)點(diǎn)資源的情況下,優(yōu)先安排北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國(guó)家研究院牽頭和參與的項(xiàng)目任務(wù),同等條件下優(yōu)先安排國(guó)家部委委托任務(wù)。默認(rèn)共享100M帶寬,申請(qǐng)獨(dú)立帶寬需額外收費(fèi) |
校外用戶:
計(jì)費(fèi)類別 |
計(jì)費(fèi)方式 |
節(jié)點(diǎn)類型 |
使用費(fèi)用 |
節(jié)點(diǎn)共享 |
作業(yè)與其他用戶的作業(yè)一起排隊(duì),所需資源具備時(shí)開始運(yùn)行。不限使用時(shí)長(zhǎng),最小單位為月 |
CPU節(jié)點(diǎn) |
1600元/月*節(jié)點(diǎn) |
GPU節(jié)點(diǎn) |
4000元/月*節(jié)點(diǎn) |
||
節(jié)點(diǎn)獨(dú)享(GPU不允許獨(dú)享) |
用戶對(duì)租用的節(jié)點(diǎn)獨(dú)占使用,無(wú)需排隊(duì)。不限使用時(shí)長(zhǎng),最小單位為月。平臺(tái)提供給獨(dú)占使用的節(jié)點(diǎn)數(shù)不高于總計(jì)算資源的20% |
CPU節(jié)點(diǎn) |
3600元/月*節(jié)點(diǎn) |
儲(chǔ)存資源 |
用戶在計(jì)算節(jié)點(diǎn)中須使用單獨(dú)的用戶HOME目錄,目錄大小進(jìn)行限制。最小單位為月 |
存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn) |
240元 / 月*1TB |
備注 |
最小租用單位為月;多個(gè)項(xiàng)目共享節(jié)點(diǎn)資源的情況下,優(yōu)先安排北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國(guó)家研究院牽頭和參與的項(xiàng)目任務(wù),同等條件下優(yōu)先安排國(guó)家部委委托任務(wù)。默認(rèn)共享100M帶寬,獨(dú)立帶寬需額外收費(fèi) |
序號(hào) |
服務(wù)內(nèi)容 |
服務(wù)費(fèi)標(biāo)準(zhǔn) |
|
1 |
運(yùn)行維護(hù) |
操作系統(tǒng)升級(jí),故障處理 |
1000元/次 |
系統(tǒng)運(yùn)行狀態(tài)監(jiān)控、預(yù)警 |
100元/臺(tái)/月 |
||
應(yīng)用系統(tǒng)運(yùn)行狀態(tài)監(jiān)控、預(yù)警 |
100元/個(gè)/月 |
||
2 |
訪問(wèn)控制 |
限制服務(wù)器中應(yīng)用的被訪問(wèn)范圍,提高安全性 |
免費(fèi) |
3 |
漏洞掃描 |
強(qiáng)制定期(每月)對(duì)系統(tǒng)進(jìn)行漏洞掃描,發(fā)現(xiàn)安全隱患及時(shí)通知并做相應(yīng)處理,處理按次收費(fèi) |
1000元/次 |
4 |
網(wǎng)絡(luò)入侵、病毒、網(wǎng)絡(luò)攻擊監(jiān)測(cè)、阻斷 |
應(yīng)用多種檢測(cè)機(jī)制在出站的網(wǎng)絡(luò)流量中發(fā)現(xiàn)訪問(wèn)遠(yuǎn)控服務(wù)器,檢測(cè)機(jī)制包括應(yīng)用遠(yuǎn)控類型的情報(bào)指標(biāo)(IOC,Indicator of Compromise)、木馬協(xié)議分析特征分析、基于深度學(xué)習(xí)算法的DGA檢測(cè)方法等。并通過(guò)可視化的方式將發(fā)現(xiàn)的失陷告警、關(guān)聯(lián)主機(jī)、威脅類型等進(jìn)行關(guān)聯(lián)展示,呈現(xiàn)所有失陷情況及關(guān)聯(lián)威脅 |
100元/月 |
5 |
安全防控 |
提供出口應(yīng)用層安全防護(hù)能力 |
免費(fèi) |
6 |
公網(wǎng)IP映射 |
根據(jù)需求提供公網(wǎng)IP使用映射服務(wù)(由于IP地址有限,每個(gè)業(yè)務(wù)申請(qǐng)不得超過(guò)1個(gè)公網(wǎng)IP) |
每個(gè)公網(wǎng)IP使用費(fèi)用 2000元/年 |
7 |
VPN賬號(hào) |
利用VPN賬號(hào)可遠(yuǎn)程登錄服務(wù)器后臺(tái) |
每個(gè)VPN授權(quán)費(fèi)用1000元/年 |
8 |
日志分析審計(jì) |
對(duì)日志進(jìn)行收集分析、對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)日志審計(jì)、對(duì)異常行為進(jìn)行審計(jì),需額外收費(fèi),按次按庫(kù)收費(fèi) |
1000/個(gè)/次 |
注:用戶須遵循《北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國(guó)家研究院計(jì)算中心資源使用管理制度》中規(guī)定的單個(gè)項(xiàng)目占用存儲(chǔ)和計(jì)算資源不超過(guò)計(jì)算中心資源總量的20%。
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