杜建
職稱：助理教授、副研究員
辦公地點：北京大學醫學部醫學科技樓西樓5層
郵箱：dujian@bjmu.edu.cn
個人簡介
2017年獲南京大學信息資源管理博士學位。曾任職于北京協和醫學院醫學信息研究所，2019年11月入職北京大學醫學部。近5年，主持科技部重點研發計劃青年科學家項目、國家自然科學基金面上項目各1項。以第一/通訊作者在信息資源管理和生物醫學信息學領域國際期刊和會議Journal of the American Medical Informatics Association (JAMIA)、Science Bulletin、EClinicalMedicine、Information Processing and Management (IP&M)、Scientific Data、AMIA Annual Symposium等發表論文40余篇。擔任Nature 數據科學子刊Scientific Data編委，擔任Health Data Science，BMC Medical Informatics and Decision Making編委。入選“中國知網2024年度Top1%高被引學者”。
擔任中華醫學會醫學信息學分會委員、中華預防醫學會生物信息學分會委員、中國醫院協會醫院情報圖書專委會常委兼秘書長、中國醫院協會健康醫療大數據應用管理專委會常委、中國科學學與科技政策研究會科學計量學與信息計量學專委會委員等。基于上述平臺開展健康信息學、健康醫療大數據和醫學科技政策的交叉研究。擔任人工智能與信息計量學AII Workshop大會（2020-2025）、知識實體抽取與評估EEKE Workshop（2021-2025）、NetSci 2025 Satellite Workshop程序委員會委員等。2017年獲中國科學技術情報學會首屆青年情報科學家獎，入選中國科協青年人才托舉工程。
主要研究方向
醫學自然語言處理
醫學知識圖譜與大語言模型
健康信息治理與循證公共衛生決策
代表性科研項目
1. 科技部重點研發計劃青年科學家項目，2022YFF0712000，從生物醫學和流行病學研究數據中自動生成因果圖的系列工具研發，2022/11-2025/10，200萬元，主持
2. 國家自然科學基金面上項目，72074006，不確定性科學知識表示與計量的理論、方法與應用研究：以醫學為例，2021/1-2024/12，50萬元，主持
3. 國家自然科學基金青年項目，71603280，睡美人文獻及喚醒睡美人的王子文獻的識別方法與典型特征研究，2017/1-2019/12，17萬元，主持
代表作
1. Xie Shiyao, Zhao Wenjing, Deng Guanghui, He Guohua, He Na, Lu Zhenhua, Hu Weihua, Zhao Mingming, Du Jian*; Utilizing ChatGPT as a scientific reasoning engine to differentiate conflicting evidence and summarize challenges in controversial clinical questions. Journal of the American Medical Informatics Association, 2024,31(7):1551-1560.
2. He, Zixuan; Yang, Lan; Li, Xiaofan; Du, Jian*. Discrepancies in reported results between trial registries and journal articles for AI clinical research. EClinicalMedicine, 2025, 80: 103066
3. Xin Guo; Jiakang Huo; Wanwei Dai; Tong Wang; Han Xiao; Wenjing Zhao; Xuanyu Shi; Xueheng Wang; Yang Gao; Zhi Li; Rui Zhan; Wenli Xu; Jian Du*; Erdan Dong*. Global rehabilitation research equality index across health conditions during 1990–2019: an alignment analysis between bibliographic and epidemiological data. Science Bulletin, 2025, 70(7):1057-1061.
4. Wang, Shuang; He, Xin; Du, Jian*. Scientific commentaries are dealing with uncertainty and complexity in science. Information Processing & Management, 2024, 61(4): 103707
5. Shi, Xuanyu; Du, Jian*. Constructing a finer-grained representation of clinical trial results from ClinicalTrials.gov. Scientific Data, 2024, 11(1): 41.
6. Shuang Wang; Kai Zhang; Jian Du*. PubMed captures more fine-grained bibliographic data on scientific commentary than Web of Science: a comparative analysis. BMJ Health & Care Informatics, 2024;31:e101017.
7. Yongmei Bai; Xuanyu Shi; Jian Du*. A computable biomedical knowledge system: Toward rapidly building candidate-directed acyclic graphs. Journal of Evidence-Based Medicine, 2024; 17: 307–316.
8. Wang, Shuang; Du, Jian*. A comment-driven evidence appraisal approach to promoting research findings into practice when only uncertain evidence is available. Health Research Policy and Systems, 2023, 21(1): 25.
9. Li, Xiaoying; Peng, Suyuan; Du, Jian*. Towards medical knowmetrics: representing and computing medical knowledge using semantic predications as the knowledge unit and the uncertainty as the knowledge context. Scientometrics, 2021,126, (7):6225-6251.
10. Du, Jian; Tang, Xiaoli; Wu, Yishan. The effects of research level and article type on the differences between citation metrics and F1000 recommendations. Journal of the Association for Information Science and Technology, 2016, 67, (12):3008-3021.
發明專利
1. 杜建; 史軒宇; 白永梅; 基于知識圖譜的因果圖生成方法、系統，2023-12-12, 中國，202311694543.3.
2. 杜建; 趙文靜; 未驗醫學知識的識別與處理方法、裝置及計算機可讀介質，2023-12-01, 中國，202311239773.0.
開發軟件/系統
1. CBK System是結構化醫學知識系統（Computable Biomedical Knowledge System）的簡稱，是存儲、檢索和可視化Medline文獻數據庫中句子層級的三元組的軟件工具。該系統由北京大學健康醫療大數據國家研究院醫學知識計算實驗室開發，定期更新美國國立醫學圖書館的Semantic Medline Database（SemMedDB）知識庫，提供基于web的醫學概念及其關系的檢索與下載服務；含路徑推斷（X-Y-Z）模塊，支持頭尾概念之間機制路徑的發現；含因果圖生成模塊，支持兩個臨床變量（或醫學概念）之間的混雜變量、中介變量和對撞變量的發現；提供三元組數據集的csv格式下載，支持導入其他圖數據庫（如Neo4j），開展進一步的圖數據科學研究和圖挖掘應用。https://cbk.bjmu.edu.cn/
2. 醫學自然語言處理系統（Health Nature Language Processing System, HNLP System): https://hnlp.bjmu.edu.cn/
主講課程
2020-,《健康數據科學——醫學術語體系與文本挖掘》（4學時）, 博士碩士研究生；
2021-,《開放數據獲取與醫學知識發現》（28學時），博士碩士研究生。
2024-,《玩兒轉PubMed數據庫探索網絡醫學》（18學時），本科生
2025-,《醫學人工智能通識——文本挖掘與大語言模型》（3學時），本科生
2023-,《人工智能與文獻挖掘》（20學時），北京大學臨床數據科學家繼續教育培訓系列課程
獲2023年度醫學部機關直屬單位青年教師“科研成果進課堂”教學比賽一等獎、最佳教案獎
獲北京大學第二十四屆青年教師教學基本功比賽（醫科類）三等獎
